穿梭貨架系統是有倉儲貨架系統和穿梭車組合在一起實現倉庫立體空間充分利用的庫房貨架，穿梭車貨架的外觀和結構有些類似于駛入式貨架（貫通貨架），但與貫通貨架相比較，又有許多的逾越的地方。

由于穿梭貨架和貫通貨架的排布同屬于密集貨架布局，使用這兩種貨架的庫房的容積率可以提高兩倍或三倍，所以穿梭車貨架和貫通式貨架的庫房的高容積率是其他所有倉儲貨架無法實現的。

無論是穿梭貨架還是貫通貨架，貨物的存取都會運用叉車，穿梭式貨架只要用叉車把貨物放在穿梭貨架的一頭即可，隨后過程交給穿梭臺車來完成，這樣可以減少或避免了叉車對貨架的些許的危害，而貫通式貨架就需求叉車進入貨架的內部進行上貨與取貨的操作，由于叉車在狹窄的貨架通道內行走，無法避免差車和貨架之間的碰撞，在使用貫通貨架時通常會在叉車通道內加裝叉車導軌，減小對叉車操作人員的要求，而從相同倉庫的庫容量比較，穿梭車貨架明顯比重型貨架、壓入式貨架、重力式貨架有著更高的存儲優勢。貫通貨架盡管同樣是密集式存貨方法，但在安全穩定性上，與穿梭式貨架比較稍有短缺。

穿梭車貨架的最大的優勢還是表現在它們的自動化存儲模式上，采用無線遙控的方式對穿梭車進行控制，操作方便快捷。而在自動化倉儲范疇里，穿梭車貨架屬于比較綜合性的自動化立體庫，在締造本錢上也更具優勢，在可終端操控的穿梭車貨架體系中，可根據庫房結構和貨物的進出實際情況靈活地選擇先進先出或先進后出功用。因為其自動化的規劃運轉優勢，穿梭車貨架非常的適合在冷庫、保稅倉庫、物流倉庫等極點庫房中的運用，在原來的工作人員基礎上削減倉庫設備操作，提高實際的工作效率。